Η Ειδική Υπηρεσία Διαχείρισης Ε.Π. Κρήτης (άρθρο 7 του Ν.4314/2014) είναι Ειδική Υπηρεσία με αρμοδιότητα, τη διαχείριση, την παρακολούθηση και τον έλεγχο των αναπτυξιακών παρεμβάσεων - έργων που συγχρηματοδοτούνται από τα Διαρθρωτικά Ταμεία (ΕΔΕΤ) της Ευρωπαϊκής Ένωσης στο πλαίσιο :
α) του ΕΠ Κρήτης και Νήσων Αιγαίου 2007-2013
β) των προγραμμάτων Αγροτικής Ανάπτυξης, ΕΠΕΡΑΑ και ΕΠΑΝΑΔ της περιόδου 2007-2013
γ) του ΕΠ ΚΡΗΤΗ 2014-2020
δ) του ΕΠ ΥΜΕΠΕΡΑΑ 2014-2020 (Ταμείο Συνοχής)
ε) του ΕΠ Αγροτική Ανάπτυξη 2014-2020
Οι αρμοδιότητες της ΕΥΔ ΕΠ Περιφέρειας Κρήτης περιγράφονται αναλυτικά στο Ν. 4314/2014, «Για τη διαχείριση, τον έλεγχο και την εφαρμογή αναπτυξιακών παρεμβάσεων για την προγραμματική περίοδο 2014−2020» (ΦΕΚ τ.Α/265/23.12.2014) καθώς και στην ΚΥΑ σύστασης της υπηρεσίας.